Am 29. Mai 1279 schenkte Bischof Heinrich II. von Regensburg dem Kloster Rott am Inn das Waldgebiet zwischen Osser, Arber und Zwercheck. Ab 1555 wurden Glasmacher in Lohberg sesshaft. Ab dem 17. Jahr-hundert wird in Lohberg von einer Kapelle berichtet. 1873 fasste man den Beschluss zum Bau einer Kirche. 1883 wurde die Weihe der neuen Kirche zur Ehren der Hl. Walburga vollzogen, als Filialkirche der Pfarrei Lam. Am 1.7.1922 erhob man Lohberg zur eigenen Pfarrei.
In der Nacht vom 9. zum 10.1.1959 fiel die Pfarrkirche den Flammen zum Opfer. Der Hochaltar mit dem Allerheiligsten und die beiden Seitenaltäre konnten gerettet werden. Bereits am 9.10.1960 wurde das neu errichtete Gotteshaus wieder eingeweiht.
1982 hielt Pfarrer Ambros Trummer Einzug in Lohberg. Da die Feier des „Hundertjährigen“ vor der Tür stand, entschloss man sich zu einer Außenrenovierung der Kirche. Im April 1984 konnte begonnen werden. 1991/92 folgte die umfassende Innenrenovierung. Sie wurde beim Pfarrfest 1995 mit der Weihe des neuen Volksaltares abgeschlossen. Dabei entstand auch der „Sternenhimmel“ über unserem Altar. Einzelne Sterne mit Nummer kann man für eine „Renovierungsgabe“ erwerben.
Wegen starker Verrußung, enormen Schäden am Balkenwerk und abblätternden Dachziegeln war 2018 eine erneute, gründliche Außen- und 2020 eine Innenrenovierung notwendig. Dabei ist auch die 60 Jahre alte Weise-Orgel komplett ausgebaut, gesäubert und neu eingestellt worden.